นิกิตาดำเนินเรื่องพลิกผันในฤดูกาลที่สามต่อไป หลังจากที่นิกิต้าและไมเคิลช่วยอเล็กซ์ล้างแค้นให้กับการตายของพ่อเธอ และทำลายเพอร์ซี ผู้สร้าง Division เหล่าสายลับสุดโกงเหล่านี้ก็ได้ก่อตั้งทีมที่แข็งแกร่งขึ้น ร่วมกับแฮ็กเกอร์แนวพังก์ร็อก ซีมัวร์ เบอร์คอฟฟ์ นักวิเคราะห์ของ CIA ไรอัน เฟลทเชอร์ และอดีตหน่วยซีลกองทัพเรือ ฌอน เพียร์ซ แต่อแมนดายังคงอยู่ที่นั่น เช่นเดียวกับเจ้าหน้าที่ของดิวิชั่น — และพวกเขาจะต้องถูกหยุดยั้ง