ข้อมูลภาพยนตร์:Manifest (เที่ยวบินพิศวง) ซีซัน 3 เล่าเรื่องราวต่อเนื่องจากการค้นพบชิ้นส่วนปีกของเที่ยวบิน 828 ในทะเล ซึ่งยิ่งเพิ่มปริมาณความลับและปริศนาธรรมให้กับบรรดาผู้โดยสาร นำโดย เบน สโตน และ มิเคลา สโตน ในซีซันนี้ เบนเริ่มหมกมุ่นกับการค้นหาความจริงเกี่ยวกับ เสียงเรียก (Callings) และเชื่อว่าชิ้นส่วนเรือโนอาห์อาจเป็นกุญแจสำคัญในการรอดพ้นจาก วันหมดอายุ (Death Date) ที่กำลังกระชั้นชิดเข้ามา ในขณะเดียวกัน รัฐบาลได้ก่อตั้งศูนย์วิจัยลับ Eureka เพื่อศึกษาชิ้นส่วนเครื่องบินและตัวผู้โดยสารอย่างจริงจัง ซึ่งยิ่งสร้างความขัดแย้งระหว่างฝั่งที่เชื่อในปาฏิหาริย์ทางศาสนากับฝั่งที่พยายามอธิบายด้วยวิทยาศาสตร์สถานการณ์ยิ่งเลวร้ายลงเมื่อบรรดาผู้โดยสารเริ่มแตกแยกออกเป็นสองฝ่าย ฝ่ายหนึ่งต้องการทำตามเสียงเรียกเพื่อช่วยชีวิตผู้คน แต่อีกฝ่ายนำโดย เอเดรียน และกลุ่มต่อต้านกลับเห็นว่าเสียงเรียกคือสิ่งชั่วร้ายและนำมาซึ่งภัยพิบัติ ในขณะเดียวกัน สามอาชญากรที่ฟื้นคืนชีพกลับมาจากน้ำแข็งก็กลับเข้ามาในชีวิตของผู้โดยสารเพื่อทดสอบเงื่อนไขการรอดชีวิตร่วมกัน ซึ่งส่งผลกระทบโดยตรงต่อ แองเจลินา ผู้โดยสารสาวที่สโตนช่วยชีวิตไว้ แต่เธอกลับมีความศรัทธาอย่างแรงกล้าจนเข้าขั้นคลั่งศาสนาและมองว่า เอเดน ลูกสาวตัวน้อยของเบนคือเทวทูตของเธอ เรื่องราวเดินทางไปสู่จุดพลิกผันอันน่าตกใจ เมื่อความบ้าคลั่งของแองเจลินานำไปสู่โศกนาฏกรรมครั้งใหญ่ในครอบครัวสโตน พร้อมกับการปรากฏตัวและหายไปอย่างเป็นปริศนาของเครื่องบินและตัวละครสำคัญ ซึ่งทิ้งปมความลับสุดช็อกไว้นำไปสู่บทสรุปต่อไป