ซีซันที่ 3 เริ่มต้นด้วยโศกนาฏกรรมและการพลัดพรากที่ยาวนานกว่า 20 ปี โดยเล่าขนานกันระหว่างสองช่วงเวลา หลังจาก Claire ตัดใจเดินทางผ่านหินศักดิ์สิทธิ์กลับไปยังปี 1948 เพื่อปกป้องลูกในท้อง เธอต้องพยายามสร้างชีวิตใหม่กับ Frank ในอเมริกาและเลี้ยงดู Brianna ท่ามกลางความร้าวฉานในชีวิตสมรสที่ไม่อาจประสานคืนได้ เพราะหัวใจของเธอยังคงติดค้างอยู่ในอดีต ขณะเดียวกันในศตวรรษที่ 18 Jamie รอดชีวิตอย่างปาฏิหาริย์จากสมรภูมิ Culloden แต่ต้องใช้ชีวิตอย่างหลบซ่อนและอยู่อย่างไร้จุดหมายในฐานะนักโทษสงครามและคนดูแลม้า โชคชะตาเริ่มหมุนวนกลับมาเจอกันอีกครั้งเมื่อ Brianna ในวัยสาวช่วยแม่สืบหาความจริงจนพบว่าเจมี่ยังมีชีวิตอยู่ แคลร์จึงตัดสินใจทิ้งโลกอนาคตและลูกสาวเพื่อย้อนเวลากลับไปหาชายผู้เป็นรักแท้อีกครั้ง การกลับมาพบกันที่โรงพิมพ์ในเอดินบะระเต็มไปด้วยความตื้นตัน แต่ชีวิตที่สงบสุขก็อยู่ได้ไม่นาน เมื่อหลานชายของเจมี่ถูกลักพาตัวไปโดยโจรสลัด ทำให้ทั้งคู่ต้องออกผจญภัยข้ามมหาสมุทรแอตแลนติกมุ่งหน้าสู่ทะเลแคริบเบียนการเดินทางครั้งนี้เต็มไปด้วยอุปสรรค ทั้งโรคระบาดบนเรือ การเผชิญหน้ากับศัตรูเก่าที่คาดไม่ถึง และความลึกลับของพิธีกรรมวูดูในจาเมกา แคลร์และเจมี่ต้องร่วมมือกันเพื่อช่วยเหลือหลานชายและเอาชีวิตรอดจากแผนการร้ายที่ซ่อนอยู่ ก่อนที่พายุลูกใหญ่จะซัดพาพวกเขาไปติดเกาะที่ชายฝั่งของทวีปอเมริกา ซึ่งกลายเป็นจุดเริ่มต้นของบทใหม่ในชีวิตที่พวกเขาจะได้สร้างรากฐานครอบครัวร่วมกันจริงๆ เสียที