ข้อมูลภาพยนตร์:ในซีซั่นนี้ The Machine ได้กลายเป็นส่วนหนึ่งของการต่อสู้ที่ยิ่งใหญ่ระหว่างสองระบบปัญญาประดิษฐ์ โดย The Machine ยังคงช่วยเหลือทีมของ Finch และ Reese ในการคัดกรองข้อมูลเพื่อป้องกันภัยคุกคามในรูปแบบต่าง ๆ ในขณะที่ Samaritan ได้กลายเป็นศัตรูที่มีการควบคุมข้อมูลและโลกภายนอกในทางที่น่าสะพรึงกลัว ในเวลาเดียวกัน ทีมต้องเผชิญหน้ากับการขยายตัวของ Control, ผู้นำขององค์กรที่คอยสอดส่องและควบคุมการใช้เทคโนโลยีของ Samaritan ซึ่งมีแผนการลึกซึ้งในการควบคุมโลก โดยที่ Shaw, Root, และ Carter (ที่กลับมามีบทบาทสำคัญในบางตอน) ได้ร่วมมือกับ Reese และ Finch ในการต่อสู้กับการคุกคามนี้ ซีซั่นนี้ยังได้ขยายบทบาทของ Root ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการเชื่อมต่อกับ The Machine และ Samaritan โดยมีภารกิจที่สำคัญในการช่วยให้ The Machine รอดจากภัยคุกคามของ Samaritan ซึ่งในหลายๆ ตอนจะมีการตัดสลับการดำเนินเรื่องระหว่างการต่อสู้เพื่อปกป้องข้อมูลที่สำคัญ และการพัฒนาความสัมพันธ์ระหว่างตัวละคร
