ข้อมูลภาพยนตร์:สงครามโคลนเดินทางมาถึงช่วงโค้งสุดท้ายและความตึงเครียดที่เพิ่มสูงขึ้นเมื่อความลับทางกลยุทธ์ของฝั่งซิธเริ่มเปิดเผย เรื่องราวเริ่มต้นขึ้นเมื่อทหารโคลนชื่อ ทัปป์ เกิดอาการคุ้มคลั่งและสังหารเจไดผู้บังคับบัญชา ทำให้ ฟิกซ์ (Fives) ออกสืบหาความจริงจนพบว่าทหารโคลนทุกคนถูกฝัง ชิปยับยั้ง (Inhibitor Chip) ไว้ในสมองตั้งแต่แรกกำเนิดเพื่อรอคำสั่งสังหารเจได แต่ก่อนที่เขาจะทันได้เตือนคำเตือนนี้แก่ใคร เขากลับถูกใส่ร้ายและสังหาร ความจริงเกี่ยวกับชิปและ คำสั่งที่ 66 จึงยังคงถูกปกปิดไว้เป็นความลับในขณะเดียวกัน โยดาได้ยินเสียงเพรียกจากจิตวิญญาณของ ไคว-กอน จินน์ จึงออกเดินทางข้ามกาแล็กซีไปยังดาวเคราะห์โบราณและโลกกำเนิดแห่งพลัง (Force) เพื่อทำความเข้าใจธรรมชาติที่แท้จริงของพลังและฝึกฝนวิชาจิตวิญญาณเพื่อรักษาสติรับมือกับความมืดมิดที่กำลังจะมาถึง นอกจากนี้ ยังมีภารกิจการเมืองและการทูตที่ซับซ้อน เช่น การสืบสวนคอร์รัปชันในธนาคารอินเตอร์กาแลกติกโดยพัดเม อมิดาลา และการช่วยชีวิตราชินีแห่งดาวบาร์โดตตาโดยจาร์ จาร์ บิงก์ส ร่วมกับเมซ วินดูฤดูกาลนี้เผยให้เห็นเงามืดของจักรพรรดิพัลพาทีนที่ค่อยๆ ถักทอแผนการขั้นสุดท้ายอย่างแยบยล ทำให้สภาเจไดตกอยู่ในความมืดมนโดยไม่รู้ตัวว่าการอวสานของนิกายเจไดและสงครามโคลนได้ถูกตระเตรียมไว้เรียบร้อยแล้ว
