ข้อมูลภาพยนตร์:ต่อจากซีซัน 1: ทีม Atlantis หลอกให้ Wraith เชื่อว่าเมืองถูกทำลาย และกลับมาเชื่อมต่อกับโลกได้อีกครั้งผ่าน Daedalus ด้วยพลังจาก Zero Point Module (ZPM) การเปลี่ยนแปลงของทีม: Lt. Ford หายไปจากทีมและถูกแทนที่ด้วย Ronon Dex ผู้รอดชีวิตจาก Wraith เป้าหมายหลัก: Dr. Carson Beckett พัฒนา retrovirus ที่มีศักยภาพจะเปลี่ยน Wraith ให้กลายเป็นมนุษย์ได้ โดยเริ่มทดสอบกับเด็ก Wraith และ Sheppard พบว่าตัวเขาเกือบถูกเปลี่ยนร่าง แต่ในที่สุดก็มีการทดสอบบน Wraith ตัวจริงชื่อ Michael โดยผลลัพธ์ยังไม่แน่นอน