ข้อมูลภาพยนตร์:เรื่องราวใน Stargate Atlantis ซีซัน 4 เปิดฉากขึ้นหลังจากซีซันก่อนที่ Atlantis ถูกโจมตีจนตกลงในอวกาศ และกำลังเผชิญวิกฤตที่คุกคามทุกชีวิตภายในเมืองทูต Samantha Carter เข้ามาช่วยนำทางในการค้นหาพลังงาน ZPM ที่จำเป็นเพื่อขับเคลื่อน Atlantis ไปยังดาวเคราะห์ใหม่ในจักรวาล Pegasus หลังจาก Dr. Weir ได้รับบาดเจ็บหนักระหว่างการหลบหนี เมื่อเมืองไปถึงจุดหมาย ทีมสำรวจต้องเผชิญกับศัตรูใหม่Asurans (Replicators รุ่นใหม่) ที่กำลังคุกคามความมั่นคงของมนุษย์ นำไปสู่การร่วมมือกันระหว่าง Atlantis, Wraith และกลุ่ม Travelers ในการกำจัดภัยคุกคามนี้
