ข้อมูลภาพยนตร์:X-Files ถูกปิดตัวลง และ Mulder และ Scully ก็แยกจากกัน สกัลลีพบว่าตัวเองกำลังสอนในชั้นเรียนที่สถาบันเอฟบีไอในเมืองควอนติโก รัฐเวอร์จิเนีย ขณะที่มัลเดอร์ได้รับมอบหมายให้ทำหน้าที่สอดแนม โดยมีเจ้าหน้าที่อเล็กซ์ ไครเซคเป็นคู่หูคนใหม่ของเขา และมีเอ็กซ์ลึกลับเป็นแหล่งข้อมูลใหม่ของเขา มัลเดอร์พยายามดิ้นรนเพื่อรักษาการค้นหาความจริงให้คงอยู่ต่อไป